疾控中心實(shí)驗(yàn)室的通風(fēng)系統(tǒng)和壓差是保證實(shí)驗(yàn)室正常運(yùn)轉(zhuǎn)的主要環(huán)節(jié)，一般無特殊要求房間除門窗通風(fēng)外，可設(shè)側(cè)墻換氣扇通風(fēng)，在理化區(qū)應(yīng)多設(shè)通風(fēng)柜及吸氣罩，凡產(chǎn)生有害氣體設(shè)備如光譜及色譜分析類設(shè)備均應(yīng)設(shè)吸氣罩，設(shè)計(jì)時應(yīng)確定位置和高度，并留有發(fā)展空間，在化學(xué)試劑庫房吸風(fēng)罩與試劑柜相連，設(shè)感應(yīng)裝置，自動排氣。所有通風(fēng)柜的排風(fēng)系統(tǒng)宜獨(dú)立設(shè)置，即“一柜一管風(fēng)機(jī)系統(tǒng)”，不宜共用風(fēng)道，不得借用消防風(fēng)道。實(shí)驗(yàn)室不宜采用不同實(shí)驗(yàn)室之間空氣交換的中央空調(diào)系統(tǒng)，避免造成交叉污染，獨(dú)立實(shí)驗(yàn)室可采用單獨(dú)空調(diào)，單元組合類實(shí)驗(yàn)室可設(shè)風(fēng)機(jī)盤管系統(tǒng)或變頻變冷媒流量一拖多系統(tǒng)。

 疾控中心實(shí)驗(yàn)室空氣凈化與壓差設(shè)計(jì)，臨床檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室無凈化要求，微生物實(shí)驗(yàn)室中消毒實(shí)驗(yàn)室設(shè)計(jì)為周邊6級~7級，局部5級，其余實(shí)驗(yàn)室設(shè)計(jì)為7級，理化實(shí)驗(yàn)室除ICP-MS設(shè)計(jì)為6級，其他實(shí)驗(yàn)室無凈化要求。設(shè)壓差的實(shí)驗(yàn)室主要有潔凈室、PCR室、結(jié)核實(shí)驗(yàn)室及病原微生物負(fù)壓BSL-2室，潔凈室之間及與室外壓差5 Pa~10 Pa為宜，PCR室的試劑配制室及樣品處理室宜微正壓（+5 Pa~+10 Pa），核酸擴(kuò)增室及產(chǎn)物分析室宜微負(fù)壓（-5 Pa~-10 Pa）。