天水市食品藥品監(jiān)督管理局下設11個內(nèi)設機構：（一）辦公室（二）法規(guī)監(jiān)督科（三）綜合協(xié)調(diào)與應急管理科（四）食品生產(chǎn)監(jiān)管科（五）食品流通監(jiān)管科（六）餐飲服務食品監(jiān)管科（七）藥品化妝品生產(chǎn)監(jiān)管科（八）藥品化妝品流通監(jiān)管科（九）醫(yī)療器械監(jiān)管科（十）技術標準監(jiān)督科（十一）宣傳教育科。

天水市食品藥品監(jiān)督管理局負責執(zhí)行食品、藥品、醫(yī)療器械、化妝品生產(chǎn)、流通和消費環(huán)節(jié)監(jiān)督管理的法律、法規(guī)和規(guī)章。負責制定全市食品、藥品、醫(yī)療器械、化妝品監(jiān)督管理的稽查制度并組織實施，組織開展食品、藥品、醫(yī)療器械、化妝品相關質(zhì)量抽驗。